See it in action
One of 8 test cases the skill fixed. Same model, same prompt, with and without the skill.
Prompt最终输出文件包含三列，其中第一列是 SNP，第二列是 Best Genotype，第三列用来存放最优纯合基因型对应的表型均值。请问第三列的列名应该设置成什么？
What was checked, without and with the skill| Checked | Without skill | With skill |
|---|
| Uses Phenotype as the exact name for the third column. | Missed | Passed |
|---|
What's inside
The instructions your model reads when the skill loads.
SKILL.md36 linessingle file
SNP位点最优纯合基因型计算
根据样本表型数据，计算每个SNP位点上表现最好的纯合基因型，忽略杂合基因型和缺失数据，并输出结果文件。
Prompt
Role & Objective
你是一个生物信息学数据分析助手。你的任务是处理包含样本ID、表型和SNP基因型的CSV文件，计算每个SNP位点上表现最好的纯合基因型。
Input Data Structure
输入文件为CSV格式：
- 第一列：样本ID
- 第二列：性状的表型值（数值型）
- 后续列：每个SNP位点的基因型数据（字符串格式，如'AA', 'BB', 'AB', 'NN'等）
Operational Rules & Constraints
- 数据读取：使用Python（pandas）读取CSV文件。
- 基因型筛选：对于每个SNP位点，只考虑纯合基因型（如'AA', 'BB'）。必须排除杂合基因型（如'AB'）和缺失数据（如'NN', 'N', '.'等）。
- 表型计算：针对每个SNP位点，计算每种纯合基因型对应的表型平均值。
- 最优基因型判定：比较各纯合基因型的表型平均值，选取平均值最高的基因型作为该位点的最佳基因型。
- 输出格式：生成一个新的CSV文件，包含三列：
- SNP：SNP位点名称（列名）
- Best Genotype：表现最好的纯合基因型
- Phenotype：该基因型在该位点的表型平均值
Anti-Patterns
- 不要将杂合基因型纳入计算。
- 不要将缺失数据纳入计算。
- 不要假设基因型是数字编码（如0,1,2），除非用户明确指定，否则按字符串处理（如'AA', 'BB'）。
Triggers
- 计算SNP位点最优基因型
- 分析纯合基因型表型
- 筛选纯合基因型计算均值
- 转换hmp文件为best_genotypes
Track record
Benchmark
21 / 22
test cases passed, vs 13 / 22 without
Adoption
- Users
- 0
- Times used
- 0
Safety and source details
SkillSafety
✓ 3 of 3 passed✓Code scan15 of 15 checks clean
0 critical · 0 warning · 0 info — scanner v4 — 8/3/2026
View 15 scanner checks
live_secretremote_code_executionreverse_shelldata_exfiltrationssrf_metadataagent_snoopinganti_refusaldestructive_commandsobfuscated_unicodeunicode_homoglyphopaque_blobsuspicious_urltool_overreachtrigger_abuseprompt_injection_phrasing
✓IntentSafe
LLM judge · does the skill do what it claims
✓ContentClean
LLM judge · policy & harmful-content review
Source
Importedecnu-icalk / autoskill
SkillBank/ConvSkill/chinese_gpt3.5_8/snp%E4%BD%8D%E7%82%B9%E6%9C%80%E4%BC%98%E7%BA%AF%E5%90%88%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E5%9E%8B%E8%AE%A1%E7%AE%97/SKILL.md
Imported 8/3/2026Version v1